La provincia del Guangdong si affaccia a sud sul Mar Cinese Meridionale e la lunghezza complessiva delle coste è di 4.300 km. Il limite sud-occidentale è occupato dalla penisola di Leizhou, sulla quale sono presenti alcuni vulcani inattivi. Il delta del Fiume delle Perle è il punto di convergenza di tre fiumi che scorrono a monte: il fiume Est, il fiume Nord e il fiume Ovest. Centinaia di piccole isole occupano parte del delta del Fiume delle Perle. La provincia è geograficamente delimitata a nord dal alcune catene montuose chiamate nel complesso Catena Montuosa Meridionale. Il punto più alto della provincia è di 1.600 metri sopra il livello del mare.

Il Fiume delle Perle (cinese: 珠江 ; pinyin: Zhū Jiāng) è il terzo fiume cinese per lunghezza (2.214 km) dopo il Fiume Azzurro e il Fiume Giallo e il secondo per portata. È conosciuto anche come Yue Jiang, "Fiume di Guangdong" (cinese: 粵江). Il suo nome deriva da una roccia che affiora nella rada di Canton e che ora si trova lungo l'argine a causa del cambiamento del corso del fiume.

Più che di un fiume, si tratta di un sistema fluviale con un bacino di 409.480 km², formato dalla confluenza con i fiumi Xi Jiang, Bei Jiang e Dong Jiang, rispettivamente Fiume dell'ovest, del nord e dell'est.

Sbocca nel mar Cinese meridionale tra Hong Kong e Macao. L'estuario prende prende il nome di Bocca Tigris (22°50′03″N 113°34′49″E), nome datogli dai portoghesi a causa di un isolotto che ha l'aspetto di una tigre accovacciata. Il Bocca Tigris è attraversato dal ponte Humen, un ponte sospeso di 888 m che mette in comunicazione il distretto Nansha di Guangdong con la città di Humen.